Набор реагентов предназначен для определения молекулярно-генетических биомаркеров эффективности противоопухолевой терапии методом высокопроизводительного секвенирования на приборе MiSeq
РУ №РЗН 2021/13662
Тест для анализа ключевых онкогенов методом NGS
Соло-тест Атлас
Набор реагентов предназначен для определения молекулярно-генетических биомаркеров эффективности противоопухолевой терапии методом высокопроизводительного секвенирования на приборе MiSeq
Набор Соло-тест Атлас включает гены, рекомендуемые для анализа пациентам со следующими нозологиями:
Клиническое значение
Набор Соло-тест Атлас
включает гены, рекомендуемые для анализа пациентам со следующими нозологиями:
Клиническое значение
Данные о частоте встречаемости вариантов приведены в соответствии с данными с BioPortal, актуальными на апрель 2021 г.
Данные о частоте встречаемости вариантов приведены
в соответствии с данными
с BioPortal, актуальными
на апрель 2021 г.
в соответствии с данными
с BioPortal, актуальными
на апрель 2021 г.
Набор позволяет детектировать соматические варианты в образцах с минимальной концентрацией ДНК 7 нг/мкл и долей мутантного аллеля 0,1%
Набор Соло-тест Атлас валидирован для анализа свободно циркулирующей ДНК при немелкоклеточном раке легкого (для жидкостной биопсии)
Набор позволяет детектировать соматические варианты
в образцах с минимальной концентрацией ДНК 7 нг/мкл
и долей мутантного аллеля 0,1%
в образцах с минимальной концентрацией ДНК 7 нг/мкл
и долей мутантного аллеля 0,1%
Набор
Соло-тест Атлас валидирован
для анализа свободно циркулирующей ДНК при немелкоклеточном раке легкого
(для жидкостной биопсии)
Соло-тест Атлас валидирован
для анализа свободно циркулирующей ДНК при немелкоклеточном раке легкого
(для жидкостной биопсии)
PMID: 30915108
Для ранней диагностики рецидива или мониторинга прогрессирования заболевания
2
Позволяет изучить спектр мутаций в опухоли и метастазах, когда гистологический материал недоступен
1
Для чего это нужно?
Позволяет изучить спектр мутаций в опухоли и метастазах, когда гистологический материал недоступен
Для ранней диагностики рецидива или мониторинга прогрессирования заболевания
PMID: 30915108
Техническая и биоинформатичес-
кая поддержка
кая поддержка
Техническая и биоинформатическая поддержка
Медицинское ПО для интерпретации результатов
Возможность одновременного анализа образцов пациентов с разными нозологиями
Встроенная защита от кросс-контаминации
Возможность одновременного анализа до 96 образцов
Простой протокол позволяет осуществить пробоподготовку за один день
Преимущества Соло-тест Атлас
Удобно пользоваться
Техническая и биоинформати-
ческая поддержка
ческая поддержка
Медицинское ПО для интерпретации результатов
Возможность одновременного анализа образцов пациентов
с разными нозологиями
с разными нозологиями
Встроенная защита
от кросс-контаминации
от кросс-контаминации
Возможность одновременного анализа до 96 образцов
Простой протокол позволяет осуществить пробоподготовку за один день
Преимущества Соло-тест Атлас
Удобно пользоваться
Требует минимальное количество стартового материала (от 10 нг)
15 генов в одной панели
Дизайн праймеров оптимизирован для работы с деградированной ДНК из парафиновых блоков
Возможен анализ циркулирующей ДНК в плазме крови
Анализ разных типов молекулярных нарушений (SNP, indel, CNV)
Высокая чувствительность и специфичность набора гарантируют надежность результата
Максимальная информативность
Требует минимальное количество стартового материала (от 10 нг)
15 генов в одной панели
Дизайн праймеров оптимизирован для работы
с деградирован-ной ДНК
из парафиновых блоков
с деградирован-ной ДНК
из парафиновых блоков
Возможен анализ циркулирующей ДНК в плазме крови
Анализ разных типов молекулярных нарушений (SNP, indel, CNV)
Высокая чувствитель-
ность
и специфич-ность набора гарантируют надежность результата
ность
и специфич-ность набора гарантируют надежность результата
Максимальная информатив-
ность
Набор включает
все реагенты для приготовления таргетных библиотек для секвенирования
Набор включает все реагенты
для приготовле-ния
таргетных библиотек
для секвениро-вания
Набор
включает
все реагенты
для
приготовле-ния
таргетных библиотек
для секвениро-вания
Секвенирование на MiSeq
Очистка продуктов амплификации. Пулирование библиотек
Очистка и пулирование готовых библиотек
Вторичная амплификация:
введение Олигонуклеотидных индексов
Введение олигонуклеотидных индексов
Лигирование ЛС адаптеров
Удаление праймеров
Подготовка к лигированию
Таргетное обогащение
на основе мультиплексной ПЦР
Как работает тест
Секвенирование на MiSeq
Очистка продуктов амплификации. Пулирование библиотек
Вторичная амплификация:
введение Олигонуклеотидных индексов
Лигирование ЛС адаптеров
Удаление праймеров
Подготовка к лигированию
Таргетное обогащение
на основе мультиплексной ПЦР
Как работает тест
Комплект для целевого обогащения ДНК
Комплект для приготовления библиотек ДНК
Состав набора
Набор Соло-тест Атлас рассчитана на проведение анализа 48 образцов
Комплект для целевого обогащения ДНК
Комплект для приготовления библиотек ДНК
Состав набора
Набор Соло-тест Атлас рассчитана на проведение анализа
48 образцов
Комплект для целевого обогащения ДНК
Комплект для приготовления библиотек ДНК
В набор входит
Набор
Соло-тест Атлас рассчитана
на проведение анализа
48 образцов
Набор Соло-тест Атлас 48-С помимо компонентов для приготовления библиотек включает все компоненты для секвенирования.
Наборы Соло-тест Атлас 48-а и Соло-тест Атлас 48-б отличаются комбинациями индексов. В одном запуске секвенирования на MiSeq при сочетании наборов с разными индексами 48а и 48б может быть объединено до 96 уникальных образцов, включая контроли.
Наборы Соло-тест Атлас 48-а и Соло-тест Атлас 48-б отличаются комбинациями индексов. В одном запуске секвенирования на MiSeq при сочетании наборов с разными индексами 48а и 48б может быть объединено до 96 уникальных образцов, включая контроли.
Соло-тест Атлас:
4 варианта наборов
Набор Соло-тест Атлас 48-С помимо компонентов для приготовления библиотек включает все компоненты для секвенирования.
Наборы Соло-тест Атлас 48-а и Соло-тест Атлас 48-б отличаются комбинациями индексов. В одном запуске секвенирования на MiSeq при сочетании наборов с разными индексами 48а и 48б может быть объединено до 96 уникальных образцов, включая контроли.
Наборы Соло-тест Атлас 48-а и Соло-тест Атлас 48-б отличаются комбинациями индексов. В одном запуске секвенирования на MiSeq при сочетании наборов с разными индексами 48а и 48б может быть объединено до 96 уникальных образцов, включая контроли.
При этом минимальное покрытие для одного образца — 350х
MiSeq Reagent kit v2 300 cycles
в одном запуске можно объединить до 96 образцов
в одном запуске можно объединить до 96 образцов
Параметры секвенирования
Технические и диагностические характеристики
При этом минимальное покрытие для одного образца — 350х
MiSeq Reagent kit v2 300 cycles
в одном запуске можно объединить до 96 образцов
в одном запуске можно объединить до 96 образцов
Параметры секвенирования
Технические и диагностические характеристики
При этом минимальное покрытие для одного образца — 350х
MiSeq Reagent kit v2 300 cycles в одном запуске можно объединить
до 96 образцов
до 96 образцов
Параметры секвенирования
Технические и диагностические характеристики
(при условии, что каждому образцу в запуске соответствует уникальная комбинация индексов)
Библиотеки, приготовленные с помощью набора Соло-тест Атлас можно сочетать в одном запуске с библиотеками, приготовленными с помощью набора Соло-тест ABC
(при условии, что каждому образцу в запуске соответствует уникальная комбинация индексов)
Библиотеки, приготовленные
с помощью набора Соло-тест Атлас можно сочетать
в одном запуске
с библиотеками, приготовленными с помощью набора Соло-тест ABC
с помощью набора Соло-тест Атлас можно сочетать
в одном запуске
с библиотеками, приготовленными с помощью набора Соло-тест ABC
FAQ
Минимальное количество ДНК, необходимое для работы с набором, — 18 нг (6 мкл ДНК с концентрацией 2 нг/мкл). Оптимальное количество ДНК для получения библиотек с помощью набора Соло-тест Атлас — 30 нг (6 мкл ДНК с концентрацией не менее 5 нг/мкл).
В набор включены все реагенты для приготовления библиотек из выделенной ДНК. Дополнительно потребуется только общелабораторные расходники, такие как дистиллированная вода и этиловый спирт. В лаборатории должны быть ПЦР-бокс, термоциклер, магнитный штатив, вортекс, центрифуга, анализатор Qubit и расходники для него. Для проведения секвенирования необходим секвенатор MiSeq.
Набор можно использовать для анализа ДНК из свежих биопсий или парафиновых блоков (FFPE).
- Свежая или замороженная ткань хранится до выделения ДНК не более 2 часов
- Фиксированные образцы ткани обрабатывались нейтральным забуференным формалином. Не допускать избыточной фиксации — это может вызвать деградацию ДНК и появление артефактов последовательности!
- Для анализа соматических мутаций важно чтобы содержание опухолевых клеток было не менее 30%.
Для анализа соматических мутаций рекомендовано анализировать до 96 библиотек. Ожидаемое покрытие при этом составит >600x
Да. При заказе первого набора наши специалисты проведут обучение работе с протоколом в вашей лаборатории. Кроме того, вы всегда можете обратиться к нам с любыми вопросами по работе набора.
Для обработки данных можно использовать стандартное программное обеспечение предназначенное для MiSeq, а для интерпретации результатов можно использовать ПО Соло-репорт (РУ 2019/8907). Свяжитесь с нами, чтобы получить помощь в биоинформатическом анализе.
Минимальное количество ДНК, необходимое для работы с набором, — 18 нг (6 мкл ДНК с концентрацией 2 нг/мкл). Оптимальное количество ДНК для получения библиотек с помощью набора Соло-тест Атлас — 30 нг (6 мкл ДНК с концентрацией не менее 5 нг/мкл).
В набор включены все реагенты для приготовления библиотек из выделенной ДНК. Дополнительно потребуется только общелабораторные расходники, такие как дистиллированная вода и этиловый спирт. В лаборатории должны быть ПЦР-бокс, термоциклер, магнитный штатив, вортекс, центрифуга, анализатор Qubit и расходники для него. Для проведения секвенирования необходим секвенатор MiSeq.
Набор можно использовать для анализа ДНК из свежих биопсий или парафиновых блоков (FFPE).
- Свежая или замороженная ткань хранится до выделения ДНК не более 2 часов
- Фиксированные образцы ткани обрабатывались нейтральным забуференным формалином. Не допускать избыточной фиксации — это может вызвать деградацию ДНК и появление артефактов последовательности!
- Для анализа соматических мутаций важно чтобы содержание опухолевых клеток было не менее 30%.
Для анализа соматических мутаций рекомендовано анализировать до 96 библиотек. Ожидаемое покрытие при этом составит >600x
Да. При заказе первого набора наши специалисты проведут обучение работе с протоколом в вашей лаборатории. Кроме того, вы всегда можете обратиться к нам с любыми вопросами по работе набора.
Для обработки данных можно использовать стандартное программное обеспечение предназначенное для MiSeq, а для интерпретации результатов можно использовать ПО Соло-репорт (РУ 2019/8907). Свяжитесь с нами, чтобы получить помощь в биоинформатическом анализе.